L'umanità era un tempo in pericolo di essere soggiogata dall'impero sotterraneo del Dottor Inferno, uno scienziato malvagio. Koji Kabuto però, pilotando il prodigioso super robot Mazinga Z e aiutato dai suoi amici del laboratorio Photon Power, riuscì a sconfiggere il Dottor Inferno e a riportare la pace nel mondo. Da allora sono passati dieci anni e Koji non è più un pilota bensì, come suo nonno e suo padre, si dedica alla scienza. Durante un'esplorazione nel sottosuolo del Monte Fuji trova una misteriosa ed enorme struttura chiamata Infinity, opera del Dottor Inferno e delle sue forze malvagie. A causa dell'enorme potere distruttivo di Infinity, l'umanità rischia l'estinzione. Koji è quindi costretto a riprendere i comandi di Mazinga Z e ad affrontare ancora una volta il dilemma della sua vita "diventare dio o demone".